Esta música será para sempre ou programação de DNA

Você pode escrever sobre coisas diferentes, ainda mais - sobre coisas diferentes. Portanto, a programação como tal também não se limita a determinados frameworks, familiares a todos os estereótipos associados aos computadores. Anteriormente, Habré já publicou artigos sobre a chamada programação literária e por que ela pode ser ainda melhor do que a programação clássica. Infelizmente, também explica por que não é tão difundido - tente encaixar um bom escritor e programador em uma pessoa. Mas se você pegar um poeta ...







Mas estou me adiantando, essa história começou um pouco antes, em 1966, quando nasceu no dia 10 de agosto um homem que ao nascer recebeu um nome muito interessante - Livro Cristão , que diz pelo menos que seus pais eram bonitos pessoas excêntricas. A criança posteriormente amadureceu e mudou-o para um mais eufônico, passando a se chamar Christian Bök. É importante notar que ele não é um escandinavo - é antes uma homenagem à cultura dos povos do norte, como o notório "ö" sugere.



Apesar de os pais chamarem o filho de maneira tão extravagante, eles ainda cuidaram bem de sua educação. Boeck obteve seu BA e MA pela Carleton University e seu PhD em Inglês pela York University em Toronto, onde se interessou pela poética de vanguarda de escritores canadenses como bpNichol, Steve McCaffery e Darren Wershler-Henry. Talvez seus anos de universidade possam ser considerados o ponto de partida de um caminho muito longo no caminho da poesia. A sua paixão pela língua não foi em vão e o fez pensar na eternidade e na literatura como forma de deixar a sua marca neste mundo.



Ele começou, a princípio, de uma forma relativamente padronizada, com o lançamento de coleções de poesia, nas quais apenas revisou alguns termos. Por exemplo, ele decidiu "confiscar" o termo "cristalografia" dos geólogos, e parafusá-lo na literatura, já que em sua opinião é mais adequado para escritores, porque "cristal" também é puro, e "grapho" significa escrever. Sua coleção "Cristalografia" foi indicada para o prestigioso Prêmio Gerald Lampert Memorial, que o estimulou a continuar seus experimentos literários. O próximo foi o livro Eunoia (Coach House Books, 2001), que tinha uma estrutura muito interessante - um lipograma, onde cada capítulo tinha apenas uma vogal. Esta coleção ganhou o Prêmio Griffin de Poesia em 2002.



Os juízes apreciaram esse trocadilho especialmente quando você considera que o título deste livro continha cinco vogais e ao mesmo tempo era a palavra mais curta da língua inglesa com tais propriedades. De acordo com a comissão, a abordagem de Christian permitiu revelar adequadamente o tema da obra e transmitir seu significado aos leitores muito melhor. Para mim, trata-se de uma tentativa de superar concorrentes anteriores e até atuais, em detrimento do seu próprio estilo, e desde que o prêmio foi entregue, pode ser considerado um sucesso. Até agora, tudo estava dentro de uma estrutura bastante familiar para a compreensão humana, e se tudo tivesse permanecido assim, então este texto em si não existia.





Além de seus talentos literários, Christian Boeck também começou uma carreira de professor na Universidade de Calgary, o que significa que ele ganhou acesso a laboratórios, que foram muito úteis para ele. Em algum lugar lá, ele notou uma bactéria interessante Escherichia coli, mais conhecida como E. coli. Como você sabe, é bastante difundido e frequentemente vive nos intestinos de animais de sangue quente, é principalmente inofensivo, com exceção de uma cepa. Christian não se importou com o perigo, ele decidiu atacar essa bactéria por causa de sua prevalência e singularidade, já que, para ele, a poesia deveria viver para sempre.





A E. coli também foi escolhida por ser muito mais fácil trabalhar com ela, o que foi comprovado por vários experimentos realizados anteriormente. Além disso, foi com ela que começou a biotecnologia. Mais precisamente, começou com E. coli e uma loja gourmet em Honolulu, que não existe mais. Não é uma questão de mãos sujas do chef; dois cientistas bastante importantes cruzaram lá - Stanley Cohen, um dos fundadores da biotecnologia moderna, e o bioquímico Herbert Boyer da Universidade da Califórnia em San Francisco. Eles viajaram para Honolulu para participar de uma reunião sobre plasmídeos de anel de DNA em bactérias.





Cohen sugeriu que é possível editar Escherichia coli através da introdução de DNA de plasmídeo nele, o que poderia permitir aos pesquisadores multiplicar e clonar plasmídeos nas próprias bactérias e ajudaria em pesquisas futuras. Herbert Boyer se especializou em trabalhar com enzimas, em particular apresentou a enzima ECoRI, que é capaz de clivar uma molécula de DNA de fita dupla e obter extremidades idênticas de fita simples.



Ambos viram o potencial de reunir essas duas descobertas no que se tornaria a engenharia genética. Primeiro, EcoRI deve ser usado para cortar o DNA do plasmídeo e sua porção selecionada. Então, quando os terminais de DNA idênticos estão abertos, o fragmento de DNA selecionado é anexado ao DNA de plasmídeo e clonado junto em E. coli.



Eles primeiro discutiram a colaboração em uma mercearia perto da praia de Waikiki. A conversa deles durante um jantar tardio levou a uma realização científica que posteriormente abalou o mundo da ciência. Ao longo de um ano, eles clonaram moléculas de DNA obtidas por meio do splicing de fragmentos de DNA de dois plasmídeos diferentes, criando assim o DNA recombinante. As bases da biotecnologia foram estabelecidas.



Boyer e Cohen seguiram caminhos diferentes, ambos preocupados com a segurança da tecnologia de DNA recombinante (levando à conferência Asilomar de 1975, onde cientistas, especialistas em ética e jornalistas ponderaram sobre as implicações da engenharia genética). Enquanto Cohen permaneceu na academia e defendeu a tecnologia de DNA recombinante em audiências no Congresso, Boyer viu o potencial de lucro. Em 1976, em South San Francisco, Boyer e o capitalista de risco Robert Swenson fundaram a Genentech, a primeira empresa de biotecnologia do mundo.



Os pioneiros da Genentech no California Institute of Technology foram os primeiros a sintetizar DNA em laboratório. Eles queriam usar a E. coli como uma fábrica para sintetizar proteínas de mamíferos. A prova de princípio foi demonstrada anteriormente por Cohen e seus colegas em Stanford, quando usaram bactérias para fazer uma proteína de célula de camundongo funcional. Os cientistas da Genentech finalmente conseguiram produzir um hormônio humano chamado somatostatina nas bactérias - e assim inaugurou a era da biotecnologia comercial. A produção de insulina e hormônio do crescimento começou logo em seguida.



A essência do primeiro experimento



Visto que para os biotecnólogos a E. coli era uma coisa familiar e freqüentemente usada em vários tipos de pesquisa, a escolha de nosso poeta se torna bastante clara. Resta descobrir o que exatamente o inspirou, por que ele decidiu entrar em contato com a biotecnologia. E mais um fato interessante deve ser levado em consideração - seu trabalho anterior, "Eunoia", tornou-se um best-seller absoluto, e ele poderia descansar sobre os louros, já que para a poesia, especialmente a poesia canadense, tal feito é impressionante.



Mas não. Interessado em um experimento de Park Chung-Wong e sua equipe de cientistas do Pacific Northwest National Laboratory em Richland, Washington, que conseguiram criptografar as letras da música "It's A Small World" de Walt Disney em bactérias e reconstruir a mensagem após várias gerações de reprodução, Böck decidiu tente algo semelhante com uma obra original, ou seja, um poema. Mas apenas escrever um verso no gene não foi suficiente para o canadense. Ele decidiu fazer algo diferente.  





“O que eu esperava fazer”, diz Boeck, “era empurrar esses projetos um pouco, tentando fazer o corpo realmente ler a mensagem e fazer algo em resposta ... Eu projetei o poema de tal forma que quando é implantado naquele corpo, o corpo pode realmente ler sequência de genes e interpretá-la como um conjunto de instruções para a construção de uma proteína. "




Ao mesmo tempo, sugeriu Beck, o corpo deve ser capaz de decifrar o segundo poema criptografado dentro do primeiro.



"Em essência, tenho que escrever um poema para que possa ser traduzido pelo corpo em outro poema."




O principal impacto que impulsionou esse grande experimento veio de algum lugar incomumente comum: as páginas do quebra-cabeça de um jornal diário. Boeck se perguntou, olhando os criptogramas, nos quais uma pessoa analisa a ordem e a frequência das letras para decifrar uma frase distinguível, por que os criadores de quebra-cabeças nunca pensaram em tornar a mensagem original codificada distinguível por si mesma.



Por que não criar um quebra-cabeça que possa codificar uma frase gramaticalmente correta dentro de outra? Para que a charada seja em si mesma e possa mudar com o tempo. Foi assim que nasceu a Xenotext.



Como o poema codificado na própria bactéria, o Xenotext se divide em duas partes. O primeiro volume, publicado neste outono na Coach House Books, é descrito pelo poeta como "uma espécie de trailer de filme" para o que aparece no segundo volume, que detalhará os resultados do experimento em andamento. "Os poemas de xenotexto reais, os dados, todas essas coisas loucas de ficção científica - tudo isso vai aparecer no segundo livro."



No espírito dos pensadores do passado, Boeck concebeu um exercício que explora o potencial estético da genética no ambiente moderno, a fim de literalizar o famoso aforismo de William S. Burroughs, que declarou: “A palavra agora é um vírus”. Nesta experiência, ele se propôs a considerar algumas das implicações sociológicas da biotecnologia, criando "Xenotext" - um poema bonito e anômalo onde "palavras estranhas" poderiam existir, como um parasita inofensivo, dentro da célula de outra forma de vida.



Outro cientista, Stuart Kaufman, concordou em fornecer a Boeck seu laboratório em suas horas vagas, para que ele pudesse compor uma amostra de sua "poesia viva". Kaufman é um teórico renomado que argumentou que a estrutura complexa mas ordenada de cada sistema vivo surge espontaneamente dos princípios fundamentais da auto-organização, não menos importante do que as leis da evolução seletiva. Ele foi educado em humanidades (com a intenção de se tornar um poeta) e depois seguiu uma carreira no estudo da genética. Assim, os caminhos das duas pessoas se cruzaram, e elas resolveram trabalhar juntas para imortalizar seus nomes.



“Proponho codificar um pequeno verso em uma sequência de DNA para implantá-lo em uma bactéria, depois do qual pretendo documentar o curso desse experimento para publicação. Também pretendo fazer obras de arte correspondentes para a exposição subsequente ”, Boeck compartilhou seus planos.




O resultado foi o seguinte.



A proteína fluorescente transmitiu uma mensagem:

o faery é rosa de brilho no destino que confiamos ...



E os códons complementares que orientam sua construção são o segundo, com um significado diferente:

qualquer estilo de vida é primoh, fique minha lira ...



«, , — « », . « », — . — , . «, », — , — . ».




O poema é curto (para que o texto genético codificado possa caber facilmente no genoma sem afetar a função do próprio organismo). Em última análise, o trabalho lida com a relação entre linguagem e genética de uma forma auto-reflexiva e introspectiva. Isso transmite a beleza do texto poético e de sua forma biótica.



No entanto, E. coli não satisfazia particularmente os requisitos para a imortalidade da obra, que o poeta tanto desejava alcançar com suas obras. Além disso, o anteriormente mencionado Pak Chung-Wong revelou-se muito mais insano. Para seus experimentos, ele usou uma bactéria muito interessante - Deinococcus radiodurans.



Deinococcus radiodurans





Deinococcus radiodurans é uma bactéria extremofílica, um dos organismos mais resistentes à radiação. Ela pode sobreviver ao frio, à desidratação, ao vácuo e à acidez, por isso é conhecida como poliestremófila e está listada no Livro de Recordes do Guinness como a bactéria mais resistente do mundo.



Uma expansão específica de algumas famílias de proteínas foi observada na análise de vários genomas bacterianos. Em muitos casos, parece haver alguma conexão entre as famílias de proteínas e o habitat das bactérias. D. radiodurans possui uma série de famílias que são significativamente expandidas em relação a outras bactérias.



D. radiodurans pode suportar uma dose de até 10.000 cinzas, apesar do fato de que uma pessoa só pode suportar 5 cinzas.



 Presumivelmente, a alta resistência à ação da radiação ionizante surgiu em decorrência do surgimento da resistência ao ressecamento, uma vez que os mecanismos de dano ao DNA e, consequentemente, resistência à radiação e ao ressecamento são semelhantes; aliás, D. radiodurans sintetiza os chamados. Proteínas LEA que evitam a agregação de proteínas durante a secagem.



A escolha torna-se geralmente clara - esta bactéria é quase impossível de matar, é capaz de sobreviver em um reator nuclear, tolera perfeitamente o calor, a seca, o frio e a radiação. Portanto, se algo está escrito dentro de uma determinada bactéria, é bem possível que persista por milhões de anos ou mesmo sobreviva à humanidade. Além disso, ele se multiplicará em uma escala incrível.



O valor da experiência



O experimento Xenotext busca “infectar” a linguagem da genética com os vetores poéticos de seu próprio discurso, fazendo isso para expandir a própria poesia para além dos limites formais do livro. Boeck previu que, à medida que a poesia se adapta ao estado milenar de tal tecnologia inovadora, um poema pode em breve se assemelhar a um gênero estranho de ficção científica, e um poeta pode se tornar uma espécie de técnico trabalhando em um laboratório linguístico. O poeta espera que o projeto realmente gere polêmica sobre o futuro da ciência e da poética.



“Prevemos que, se a ciência pode melhorar o processo de implantação de informações textuais extensas no embrião, não podemos apenas fornecer um método seguro de transmissão de documentos secretos, mas também células com marca d'água para rastrear o movimento de doenças microbianas ou produtos vegetais. Acreditamos que, com um desenvolvimento tão rápido da tecnologia, os livros do futuro podem não assumir mais a forma de códigos, pergaminhos ou tablets, mas podem ser integrados na própria vida de seus leitores. "


O projeto destaca até que ponto os ambientes sociais modernos agora pressupõem que as estruturas discursivas da epidemiologia (como visto, por exemplo, em termos como marketing viral ou computação viral) podem ser aplicadas para transmitir ideias em todo o nosso cultura.



Se o poeta desempenha o papel de "hospedeiro" do "germe" da palavra, pode ter de inventar um vocabulário mais inovador para descrever essa "epidemia" chamada linguagem. Tal poema poderia demonstrar que, com a ajuda de emissários biológicos nanoscópicos, poderíamos começar a transmitir mensagens através de distâncias interestelares ou até mesmo intervalos de época, de modo que, ao contrário de qualquer outro artefato cultural criado até agora (com a possível exceção de sondas- pioneiros ou Voyagers), tal poema, armazenado no genoma de uma bactéria, poderia presumivelmente sobreviver à própria civilização terrestre, preservado como uma mensagem secreta em uma garrafa acidentalmente jogada em um oceano gigante, perpetuando-nos assim.







UPD: corrigido o título do artigo para não enganar os adeptos do método de programação genética.



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